Christophe Pouzat

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MAP5
CNRS UMR 8145
45, rue des Saints Pères
75270 Paris Cedex 06
France
tél : +33176530382
sip: xtof_pouzat@sip.linphone.org
christophe.pouzat-at-parisdescartes.fr

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Parcours

Recherche

Ayant un bagage en neurophysiologie expérimentale, je travaille principalement sur des données de ce domaine. Ce travail peut être scindé en trois catégories – les mots-clés suivant relient les problèmes étudiés à des méthodes statistiques spécifiques :

  • tri des potentiels d'action – réduction de dimensions, classification non supervisée et supervisée, mélanges gaussiens, algorithme EM, MCMC (voir la page Spike sorting pour des explications en anglais) ;
  • analyse des séquences de potentiels d'action – processus ponctuels / processus de comptage, estimation de l'intensité conditionnelle, estimation non paramétrique, splines de lissage, tests de qualité d'ajustement, théorème de Donsker ;
  • imagerie calcique – régression de Poisson, stabilisation de la variance, modèles paramétriques et non paramétriques, segmentation d'images.

Dans tous les projets auxquels je participe, je m'efforce de mettre les principes de recherche reproductible (que je préfère appeler « analyse reproductible de données ») en pratique.

Collaborations

  • Au sein de l'Université Paris-Descartes, je collabore avec :
    • Yves Rozenholc pour le développement de méthodes non-paramétriques pour l'analyse des mesures de concentration calcique par fluorescence ;
    • Avner Bar-Hen pour le développement de tests de qualité d'ajustement pour les modèles de processus de comptage ;
  • Dans le reste du Monde, je collabore avec :
    • Peter Kloppenburg de l'Université de Cologne (Allemagne), ma principale « source de données » ;
    • Chong Gu de l'Université de Purdue (USA) avec lequel nous développons une approche basée sur les splines de lissage de l'estimation de l'intensité des processus de comptage utilisés pour modéliser les séquences de potentiels d'action ;
    • Clément Léna du Groupe Cervelet (Biologie, École Normale Supérieure, Paris) pour l'analyse des enregistrements « MEA » effectués in vivo dans le cervelet de rongeur ;
    • Antoine Chaillet et Georgios Detorakis (Supélec) ainsi que Yann-Suhan Senova (Équipe d'accueil 4391 - Excitabilité nerveuse et thérapeutique, Hôpital Henri Mondor, Créteil, France) pour le tri des potentiels d'action et l'analyse des séquences de potentiels d'action enregistrées in vivo chez le primate dans le cadre du projet ANR SynchNeuro ;
    • Patricia Reynaud-Bouret, Christine Tuleau et Frank Grammont (laboratoire J. A. Dieudonné de l'Université de Nice Sophia-Antipolis) sur l'analyse des séquences de potentiels d'action ;
    • Antonio Galves (NeuroMat at the University of São Paulo) sur le tri des potentiels d'action et l'analyse des séquences de potentiels d'action.

Notes de cours

Séminaires, exposés, etc.

Publications

Mes cinq dernières publications:

  • Lars Paeger, Andreas Pippow, Simon Hess, Moritz Paehler, Andreas Husch, Christophe Pouzat, Jens C. Brüning, Peter Kloppenburg (2017) Energy imbalance alters Ca2+-handling and excitability of POMC neurons eLIFE 2017;6:e25641 doi: 10.7554/eLife.25641.
  • Stephen Eglen, Ben Marwick, Yaroslav Halchenko, Michael Hanke, Shoaib Sufi, Padraig Gleeson, R Angus Silver, Andrew Davison, Linda Lanyon, Mathew Abrams, Thomas Wachtler, David J Willshaw, Christophe Pouzat, Jean-Baptiste Poline (2017) Toward standard practices for sharing computer code and programs in neuroscience Nature Neuroscience 20: 770-773 (web, introduction par Stephen Eglen).
  • Arthur Leblois et Christophe Pouzat (2017) Multi-Unit Recording: Fundamental Concepts and New Directions in Neurobiology of Motor Control, édité par Scott L. Hooper et Ansgar Büschges, John Wiley & Sons, DOI: 10.1002/9781118873397.ch3.
  • Christophe Pouzat (2016) Analyse des enregistrements extracellulaires in Les interfaces cerveau-ordinateur 1, édité par Maureen Clerc, Laurent Bougrain et Fabien Lotte, iSTE editions. Le code permettant de refaire les figures est disponible sur GitHub.
  • Christophe Pouzat and Patricia Reynaud-Bouret (2016) Éditorial du numéro spécial sur la statistique et les neurosciences Journal de la Société Française de Statistique (in French) 157(1): 3-5. Le pdf est disponible.

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Auteur: Christophe Pouzat

Created: 2017-11-09 jeu. 16:45

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